DeepSeek Harness 插件Manifest 有效

dsh-bio-galatea

蛋白质结构预测与设计域插件，提供 ProteinMPNN、ESMFold、界面分析与设计调度等 19 个语义化工具。

终端与 TUI开发者工具

0GitHub Stars0Fork 数更新于2026-10-23

源码

安装

$ dsh plugin --profile web add @dsh-bio/dsh-bio-galatea

插件能力与用途

基于公开仓库快照由 AI 辅助整理，内容必须有源码依据；它不等同于兼容性验证或安全验证。

源码有据

dsh-bio-galatea 是 DeepSeek Harness 生态下的蛋白质结构预测与设计插件。它为 DSH agent 提供 19 个语义化工具，覆盖序列设计（ProteinMPNN / SolubleMPNN / LigandMPNN）、单链折叠与复折叠验证（ESMFold）、复合物界面分析、理化打分、多样性聚类以及跨靶预算调度与迭代记账，支持私有 Python 虚拟环境零手动自举。

核心能力

通过 ProteinMPNN、SolubleMPNN 和 LigandMPNN 执行序列反向折叠与区域重设计
使用 ESMFold 进行单链结构预测与单体复折叠验证（RMSD、pLDDT、F2Å）
分析复合物界面接触、氢键、盐桥、埋藏面积与残基级接触频率
评估序列理化指标（等电点 pI、净电荷、GRAVY、疏水矩与聚集代理）
执行候选多样性聚类、共识排序与战役台账（loop / portfolio / budget / coverage）调度管理
支持本地 CPU 与 GPU 自适应运行，模型权重路径可灵活配置

适用场景

在 DeepSeek Harness 中进行 Binder、酶及纳米抗体的结构反向序列设计
设计候选序列的单链结构预测与脱靶复折叠验证
多轮蛋白质设计战役的候选摄入、界面筛选、多样性组合选择与实验预算分配

适合谁

计算生物学研究员
蛋白质工程设计人员
生物信息学与 AI 制药开发者

文档中可确认的限制

本机不支持高显存消耗的复合物 co-folding 或超大骨架生成，需依赖外部服务
ESMFold 权重体积较大（约 2.5GB），需要预留足够的磁盘空间
复折叠指标阈值尚未完全校准，仅供筛选参考

DSH 兼容性

DSH Plugin 针对具体版本记录的运行验证证据。没有结果只代表我们尚未测试，不代表不兼容。

尚未测试目前还没有发布运行兼容性测试结果。

安全信号

来自包元数据和源码检查的客观信号。这些信息用于辅助判断，不代表绝对安全保证。

依赖数量

package.json 声明了 0 个运行依赖、0 个开发依赖、1 个 Peer 依赖和 0 个可选依赖。

信息

已声明 DSH Bundle

package.json 中声明了 DSH Bundle 元数据。

信息

已声明许可证

GitHub 报告该仓库许可证为 MIT。

信息

已获取 package.json

已获取仓库根目录 package.json，可用于 Registry 元数据检查。

信息

源码可用

本次 Registry 快照已获取公开 GitHub 源码元数据。

信息

来源与 Registry 记录

展示此条目的公开来源、Registry 分类与最近一次源码检查信息，并与运行验证结果明确分开。

源码仓库: moonbowterfly/dsh-bio-galatea
Registry 来源: GitHub · dsh-plugin topic
Registry 分类: Plugin
源码检查: f0503f1 · 2026-10-25

本页面基于公开源码信息独立收录。DSH Plugin 与 DeepSeek 及插件作者均无隶属关系；安装前请始终以作者仓库中的最新说明为准。

仓库活跃度

GitHub Stars: 0GitHub stars
Fork 数: 0
未关闭 Issue: 0
最近提交: 2026-10-23
最近发布: 2026-10-23