DeepSeek Harness 插件Manifest 有效

dsh-bio-genie

面向 DeepSeek Harness 的生物信息学「许愿式分析」插件，提供 48 个语义化工具、Biopython 执行器与 46 个领域技能。

开发者工具Skills 与工作流

2GitHub Stars0Fork 数更新于2026-09-16

源码

安装

当前仓库证据中未发现明确安装命令。

插件能力与用途

基于公开仓库快照由 AI 辅助整理，内容必须有源码依据；它不等同于兼容性验证或安全验证。

源码有据

dsh-bio-genie 是为 DeepSeek Harness 打造的生物信息学综合插件包。用户通过自然语言即可完成生物学分析需求。插件内置 48 个高频语义工具（如序列分析、酶切分析、BLAST、系统发育树、PubMed 文献与通路富集等）、46 个技能与协议配方，以及支持全功能 Biopython 的隔离执行器，具备 uv/venv 自动环境自举与国内镜像自动切换能力。

核心能力

通过隔离的 Python 运行环境（bio_python）执行任意 Biopython 代码
提供 48 个语义化生信工具，涵盖 GC 含量、六框翻译、ORF 识别、限制酶切及 k-mer 统计等
支持 NCBI 远程 BLAST 检索、多序列比对（MSA）与系统发育树构建
集成 Entrez 基因检索、PubMed 文献查询与 Enrichr 通路/GO 富集分析
零依赖自举隔离 Python 环境，支持网络故障自动切换国内镜像源
具备自愈执行（ACR）与会话记忆，支持错误自动重试与经验沉淀
内置透明性 JSONL 日志记录与出版级科研绘图顾问支持

适用场景

在 DeepSeek Harness 中使用自然语言进行 DNA、RNA 与蛋白质序列特征分析
通过 AI 自动化检索 NCBI 数据库与 PubMed 生物医学文献
模拟酶切克隆、引物设计与 ORF 编码区筛选
构建系统发育树并生成符合出版标准的生信可视化图表

适合谁

生物信息学研究人员
计算生物学学者
生命科学领域高校师生与科研工作者
基于 DeepSeek Harness 进行生信开发的工程师

文档中可确认的限制

首次启动环境引导需联网下载 uv、CPython 及相关 Python 依赖库
部分多序列比对外部二进制（如 ClustalW/MUSCLE）需宿主系统预装
依赖 Node.js ^22.19 或 >=24 运行环境

DSH 兼容性

DSH Plugin 针对具体版本记录的运行验证证据。没有结果只代表我们尚未测试，不代表不兼容。

尚未测试目前还没有发布运行兼容性测试结果。

安全信号

来自包元数据和源码检查的客观信号。这些信息用于辅助判断，不代表绝对安全保证。

目前还没有发布自动安全检查信号。

来源与 Registry 记录

展示此条目的公开来源、Registry 分类与最近一次源码检查信息，并与运行验证结果明确分开。

源码仓库: moonbowterfly/dsh-bio-genie
Registry 来源: GitHub · dsh-plugin topic
Registry 分类: Plugin Bundle
源码检查: 899fc23 · 2026-09-18

本页面基于公开源码信息独立收录。DSH Plugin 与 DeepSeek 及插件作者均无隶属关系；安装前请始终以作者仓库中的最新说明为准。

仓库活跃度

GitHub Stars: 2GitHub stars
Fork 数: 0
未关闭 Issue: 0
最近提交: 2026-09-16
最近发布: 2026-09-10