DeepSeek Harness 插件Manifest 有效

dsh-bio-human-microbiome-function-mining

面向人体微生物组酶功能挖掘与暗物质发现的 DeepSeek Harness 插件包。

终端与 TUI开发者工具安全与策略Skills 与工作流远程执行

0GitHub Stars0Fork 数更新于2026-10-12

源码

安装

当前仓库证据中未发现明确安装命令。

插件能力与用途

基于公开仓库快照由 AI 辅助整理，内容必须有源码依据；它不等同于兼容性验证或安全验证。

源码有据

dsh-bio-human-microbiome-function-mining 是一个专为 DeepSeek Harness 设计的插件包，用于从人体微生物组中挖掘目标酶与未表征功能蛋白。它将目标定义、CD-HIT 聚类、DIAMOND 序列比对、US-align 结构比对、DEER 回退检索、FedKEA 功能预测及文献审计整合成可验证的完整证据链，并输出实验验证方案。

核心能力

将目标酶、EC 编号或底物/产物对标准化为目标功能卡片
执行候选蛋白质组的 CD-HIT 去冗余与 DIAMOND 序列筛选
驱动结构预测与 US-align 结构对齐，并在必要时回退至 DEER 检索
结合 FedKEA 酶分类预测与经过核验的 PMID/DOI 文献证据审计
按优先级规则计算候选排序，并生成可证伪的湿实验验证设计方案

适用场景

在人体微生物基因组中挖掘特定代谢途径的催化酶
预测未知功能的微生物暗物质蛋白是否具有目标酶活性
自动化生成候选基因的湿实验验证方案与实验假设

适合谁

生物信息学研究人员
微生物组学学者
构建自动化酶挖掘流程的计算生物学团队

文档中可确认的限制

不内置外部生物信息学工具（如 DIAMOND、CD-HIT、US-align、DEER、Bakta、FedKEA），需用户自行配置可执行文件和数据库
不提供计算资源或云端序列检索服务

DSH 兼容性

DSH Plugin 针对具体版本记录的运行验证证据。没有结果只代表我们尚未测试，不代表不兼容。

尚未测试目前还没有发布运行兼容性测试结果。

安全信号

来自包元数据和源码检查的客观信号。这些信息用于辅助判断，不代表绝对安全保证。

依赖数量

package.json 声明了 0 个运行依赖、0 个开发依赖、3 个 Peer 依赖和 0 个可选依赖。

信息

已声明 DSH Bundle

package.json 中声明了 DSH Bundle 元数据。

信息

已声明许可证

GitHub 报告该仓库许可证为 MIT。

信息

已获取 package.json

已获取仓库根目录 package.json，可用于 Registry 元数据检查。

信息

检测到 postinstall 脚本

package.json 声明了 postinstall 生命周期脚本，在相关安装流程中可能执行。

低

源码可用

本次 Registry 快照已获取公开 GitHub 源码元数据。

信息

来源与 Registry 记录

展示此条目的公开来源、Registry 分类与最近一次源码检查信息，并与运行验证结果明确分开。

源码仓库: Liuyixin-lily/dsh-bio-human-microbiome-function-mining
Registry 来源: GitHub · dsh-plugin topic
Registry 分类: Plugin Bundle
源码检查: 43d0233 · 2026-10-25

本页面基于公开源码信息独立收录。DSH Plugin 与 DeepSeek 及插件作者均无隶属关系；安装前请始终以作者仓库中的最新说明为准。

仓库活跃度

GitHub Stars: 0GitHub stars
Fork 数: 0
未关闭 Issue: 0
最近提交: 2026-10-12
最近发布: 未发现 Release